本/雑誌

バリアントデータ検索&活用 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ

坊農秀雅/編集

5500円
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発売日 2020年09月発売
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仕様

商品番号NEOBK-2538098
JAN/ISBN 9784758122450
メディア 本/雑誌
販売羊土社
ページ数 237

著者・出版社・関連アーティスト

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    収録内容

    1 1 バリアントデータを検索する(世界)(興味ある遺伝子の数塩基多型・構造多型を調べる―dbSNP、dbVar
    2 興味あるゲノム領域にみられるバリアントを調べる―gnomAD(ノマド)
    3 Pathogenicなバリアントを調べる―ClinVar
    4 アクセス制限されたデータベースから、興味あるバリアントを保有するデータを探索・利用する―GA4GH BeaconとNBDCヒトデータベース
    5 病名・遺伝子名・バリアントのIDなどから検索してGWASの知見を活用する―GWAS catalog
    6 症状から検索して類似の稀少・遺伝性疾患を探し、未知バリアントを評価する―PubCaseFinder)
    7 2 バリアントデータを検索する(日本人)(日本人集団におけるバリアントの頻度情報を調べる―TogoVar1
    8 バリアントの詳細情報を調べる―TogoVar2
    9 日本人と日本人以外の集団のバリアント頻度を比較する―TogoVar3
    10 個人レベルのバリアント情報を活用する―Japanese Genotype-phenotype Archive(JGA)
    11 多層オミクス情報と紐付いたバリアント情報を活用する―jMorp
    12 エピゲノム・遺伝子発現情報と紐付いたバリアント情報を活用する―iMETHYL)
    13 3 がんの体細胞変異を検索する(興味あるバリアントのpathogenicity、構造や治療に与える影響などを調べる―COSMIC/COSMIC‐3D、CIViC
    14 興味あるバリアントのがん種ごとの頻度の違いを調べる―TCGAとcBioPortal
    15 興味あるがん種に特徴的なバリアントを調べる―TCGAとGDC‐DP、COSMIC)

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