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収録内容
| 1 | 1章 琵琶湖の生物多様性をめぐる歴史と環境(琵琶湖の固有魚類の研究史:江戸時代から20世紀初頭まで |
| 2 | 琵琶湖の生物多様性の由来と環境変動) |
| 3 | 2章 琵琶湖の魚類と貝類の進化史(琵琶湖の淡水魚ルーツ解明のための覚書 |
| 4 | 琵琶湖の固有魚類の進化:遺伝子からのアプローチ |
| 5 | 琵琶湖のフナとコイがきた道 |
| 6 | 琵琶湖に生息するカワニナ類の進化 |
| 7 | 琵琶湖産巻貝類の多様性と起源 |
| 8 | 琵琶湖産イシガイ類の由来 |
| 9 | 琵琶湖産貝類の成り立ちをさぐる化石たち) |
| 10 | 3章 琵琶湖の生物にとっての深底部と沖合(琵琶湖の深底部に生息する生物 |
| 11 | 琵琶湖深底部の水生貧毛類 |
| 12 | 琵琶湖沖合を回遊する魚たちの生活史の多様性) |
| 13 | 4章 新たに進化しつつある琵琶湖の生物(湖岸に生育する海浜植物の謎 |
| 14 | 琵琶湖のカゲロウ類の特徴:卵の表面構造の地域間比較 |
| 15 | 琵琶湖産シロタニガワカゲロウの生い立ち |
| 16 | 琵琶湖における広域分布種マルヒラタドロムシの遺伝的分化) |
| 17 | 5章 世界および日本の淡水生物からみた琵琶湖の生物相の特性(琵琶湖の水草相とその由来 |
| 18 | ヨコエビ類からみた琵琶湖の生物地理 |
| 19 | 琵琶湖の水族寄生虫相に関する覚書) |
| 20 | 巻末表 |
